С октября 1930 года в ЛИТМО начата вневойсковая подготовка студентов.
Военными руководителями ЛИТМО (начальниками военной кафедры) были полковники А.А.Дьяконов, М.Е. Субботин, А.Н. Одинцов, Н.Е. Евтухович, П.С. Иванов, В.Н. Забелин.
Первый выпуск младших командиров РККА (Рабоче-крестьянская Красная армия) с военной кафедры состоялся в феврале 1936 года и составил 65 человек.
В 1937 году в институте введена военная подготовка по профилю общевойсковая артиллерия.
В 1942 году в связи с эвакуацией ЛИТМО из Ленинграда начавшейся 14 марта 1942 года, военная кафедра была расформирована, военное обучение прекращено.
1944 год 31 мая – в соответствии с постановлением СНК СССР № 413 от 13.04.44. и постановлением НК ВМФ СССР и председателя ВК ВШ при СНК СССР № 250/217 от 31.05.44. в институте введено военное обучение и создана военно-морская кафедра. Начальником военно-морской кафедры назначен полковник Кузнецов Федор Васильевич (руководил ВМК с 05.44 по 10.46).
С сентября 1944 г. по 1962 год к военной подготовке привлекались все студенты института, годные по состоянию здоровья к службе в ВС СССР, в том числе и женщины. Подготовка офицеров запаса проводилась по трем профилям:
- военно-морские оптические приборы;
- радиотехнические средства военно-морского флота;
- приборы управления торпедной стрельбой.
Студентам, сдавшим экзамен по военно-морской подготовке и защитившим дипломы, приказом МО СССР присваивалось воинское звание младший инженер-лейтенант запаса.
С ноября 1946 года по июль 1955 года военно-морской кафедрой руководил инженер-капитан 1 ранга Новиков Василий Никифорович.
С июля 1955 по июнь 1967 года военно-морской кафедрой руководил капитан 1 ранга Серогодский Александр Иванович.
В 1960 году введена новая военно-учетная специальность – приборы управления стрельбой УБР.
В 1962 году введена новая военно-учетная специальность – приборы управления КЗР.
В 1963 году подготовка студентов оптического факультета переведена на новый профиль – инженер по приборам управления стрельбой морской и зенитной артиллерии и дальномерному делу. С 1963 года женщины к военной подготовке не привлекаются.
С июня 1967 года по декабрь 1977 года военно-морской кафедрой руководил капитан 1 ранга Темичев Алексей Семенович.
С 1973 года подготовка на военно-морской кафедре велась по трем профилям:
- приборы управления артиллерийским огнем;
- системы управления крылатых ракет;
- системы управления торпедного оружия.
С января 1978 года по март 1990 года военно-морской кафедрой руководил капитан 1 ранга Семьянинов Владимир Николаевич.
С 1984 года введены новые военно-учетные специальности:
- эксплуатация и ремонт приборов управления корабельной артиллерией;
- эксплуатация и ремонт бортовых приборов управления и контрольно-испытательной аппаратуры крылатых ракет надводных кораблей;
- эксплуатация и ремонт систем управления корабельных торпед.
С 1985 года введены два цикла:
1. Общая военно-морская подготовка.
2. Эксплуатация и ремонт систем корабельного оружия.
С марта 1990 года по февраль 1996 года военно-морской кафедрой руководил капитан 1 ранга Кузнецов Геннадий Иванович.
1996 год. Приказом Председателя Государственного Комитета РФ по высшей школе № 73 от 12.01.96 на базе военно-морской кафедры создан ФАКУЛЬТЕТ ВОЕННОГО ОБУЧЕНИЯ, в который вошли две военно-морских кафедры, а с июля 1996 года – три военно-морских кафедры. Начата подготовка студентов еще по трем новым военно-учетным специальностям:
- эксплуатация и ремонт артиллерийских механических, оптико-механических и оптикоэлектронных приборов;
- организация информационного обеспечения;
- организация социальной работы и правового воспитания.
С февраля 1996 года по январь 1999 года факультетом военного обучения руководил капитан 1 ранга Кузнецов Геннадий Иванович, кандидат военных наук, профессор, академик МАНЭБ, член-корреспондент ПАНИ.
1997 год. На базе факультета военного обучения в соответствии с решением Ученого Совета ИТМО, уставом ИТМО и приказом ректора № 43од от 21.02.97 создан ИНСТИТУТ КОМПЛЕКСНОГО ВОЕННОГО ОБРАЗОВАНИЯ
В августе 1997 года в составе факультета военного обучения образована четвертая военно-морская кафедра.С января 1999 года институтом комплексного военного образования и факультетом военного обучения руководил капитан 1 ранга Жигулин Георгий Петрович.
Кроме факультета военного обучения в состав ИКВО входили:
- Кафедра «Мониторинга и прогнозирования чрезвычайных ситуаций» готовящая специалистов для Северо-Западного региона министерства чрезвычайных ситуаций
- Базовая кафедра «Бортовых приборов управления вооружением и военной техники» созданная для переподготовки и доподготовки выпускников университета исходя из специфики ОАО «Научно-производственного предприятия »Радар ММС«»
- Базовая кафедра «Противодействия техническим разведкам и защиты информации»
В 2008 году в результате реформирования факультет военного обучения был расформирован. С 1 января 2009 года в Университете ИТМО функционирует военная кафедра.